The Barcelona Debates on the Human Microbiome 2024

Clàudia Arajol es médica especialista del Servicio de Aparato Digestivo y de la Unidad de Enfermedad Inflamatoria Intestinal del Hospital Universitari de Bellvitge, Hospitalet de Llobregat, España.

Adam Burgener es profesor en el Centro de Salud Global y Enfermedades de la Universidad Case Western Reserve. El tema central del programa de investigación del Dr. Burgener es entender los mecanismos del huésped y los microorganismos que son importantes para la inmunidad mucosa y la susceptibilidad a las enfermedades. Su laboratorio ha desarrollado técnicas de biología de sistemas basadas en espectrometría de masas para estudiar las barreras mucosas que desempeñan un papel clave en las respuestas del huésped al VIH. Actualmente, su laboratorio lidera dos proyectos de equipo financiados por el Instituto Canadiense de Investigación en Salud, uno para estudiar el microbioma en la transmisión y prevención del VIH, y el otro para entender el microbioma en la progresión de la enfermedad del cáncer de cuello uterino. También co-dirige otros estudios financiados por los NIH sobre la transmisión y la patogénesis del VIH.

Malu Calle es la Decana de la Facultad de Ciencias, Tecnología e Ingeniería de la Universidad de Vic – Universidad Central de Cataluña. Es Catedrática de Bioestadística y Bioinformática y líder del grupo de investigación en Bioinformática y Bioimagen (Bi-squared group) de la Universidad de Vic. Sus principales áreas de investigación son la genética estadística, el análisis de datos ómicos, el análisis de datos de microbioma y el análisis de supervivencia. Trabaja en el desarrollo de nuevos métodos para el descubrimiento de biomarcadores, la identificación de perfiles de riesgo genético y la construcción de modelos dinámicos de predicción y pronóstico de la evolución de enfermedades. Sus contribuciones incluyen enfoques innovadores para la integración de datos multi-ómicos y el análisis de datos composicionales en metagenómica. Anteriormente fue Jefa del Departamento de Biociencias (2018-2022), presidenta del Máster de Ciencias en Análisis de Datos Ómicos (2012-2020), Presidenta y Vicepresidenta de la Región Española de la Sociedad Internacional de Biométrica (2012-2013 y 2014, respectivamente).

El Dr. Fernández-Real recibió sus títulos de M.D. y Ph.D. en la Universidad de Barcelona, España. Desde entonces, ha estado investigando en inflamación crónica, metabolismo del hierro y resistencia a la insulina. Ha publicado 389 artículos indexados en PubMed, de los cuales 102 como primer autor y 118 como último autor (autor correspondiente). Es investigador principal de más de 20 proyectos competitivos nacionales e internacionales (de manera continua desde 1993) y es un ex miembro del Consejo Editorial de Diabetes Care y Clinical Chemistry, entre otros. Fue uno de los primeros autores en proponer la inflamación crónica de bajo grado en la fisiopatología de la diabetes tipo 2, la obesidad y la resistencia a la insulina, así como las reservas de hierro como componente del síndrome metabólico. La interacción del microbiota con todos estos elementos también es una línea importante de investigación. Recientemente ha sido invitado a hablar sobre su investigación en la Reunión Anual de la American Diabetes Association (San Francisco 2015), la Endocrine Society (Boston 2016) y la American Society of Nutrition (San Diego 2016), además de conferencias invitadas en reuniones de la European Association for the Study of Diabetes (Lisboa 2011), Endocrinología (Budapest 2012), Obesidad (Sofía 2014) y Nutrición (Praga 2016). Actualmente es profesor asociado en la Facultad de Medicina (Universidad de Girona), Director de Investigación en el Departamento de Endocrinología, y Director Científico del “Fat Bank”, un biobanco nacional especializado en muestras de tejido adiposo. Es investigador principal y miembro del Comité Directivo del CIBERobn, una red de excelencia en la investigación de la obesidad en España.

Profesora de Microbiología en la Universidad de Girona (Departamento de Biología) e Investigadora Principal del grupo de investigación ‘Microbiología de la Enfermedad Intestinal’ en la misma universidad. Está interesada en el estudio del microbioma intestinal humano en el contexto de las enfermedades con el objetivo de encontrar nuevas herramientas de diagnóstico y pronóstico, así como nuevos objetivos para futuros tratamientos. Se ha centrado particularmente en el papel patogénico de las poblaciones de E. coli en la enfermedad de Crohn.

La Dra. Mireia Valles-Colomer tiene formación en Microbiología y Biología Computacional (Universidad Autónoma de Barcelona, España y Universidad Libre de Bruselas, Bélgica). Después de su doctorado en la Universidad de Leuven (Bélgica), se unió al Laboratorio de Metagenómica Computacional en la Universidad de Trento (Italia) como investigadora postdoctoral de EMBO. El próximo septiembre, comenzará el Grupo de Investigación del Microbioma en la Universidad Pompeu Fabra (Barcelona) como líder de grupo en una posición de tenure-track. Su investigación se centra en el papel del microbioma humano en la salud mental y la transmisión del microbioma entre individuos. Ha desarrollado herramientas para caracterizar la producción y degradación microbiana de compuestos neuroactivos en datos metagenómicos y realizó el primer estudio a nivel poblacional sobre la relación entre el microbioma intestinal y la ansiedad y depresión del huésped (Valles-Colomer et al, Nat. Microbiology 2019). El estudio fue incluido en “Nature milestones 2019” como un artículo destacado en la investigación del microbioma humano y recibió una recomendación de F1000Prime. Su trabajo sobre el paisaje de transmisión de los microbiomas intestinal y oral se publicó recientemente (Valles-Colomer et al, Nat. Microbiology 2022; Valles-Colomer et al, Nature 2023).

El dr. Clotet se licenció en Medicina (1976) y obtuvo su doctorado (1981) con una tesis sobre enfermedades autoinmunes, por la Universidad Autónoma de Barcelona (UAB). Ese mismo año, su práctica como especialista en Medicina Interna en el Hospital Universitario Vall d’Hebron de Barcelona coincidió con el primer caso de sida denunciado en España. Este caso fue el catalizador de una trayectoria dedicada a esta grave enfermedad, primero como jefe de la Unidad de VIH del Hospital Universitario Germans Trias y Pujol de Badalona (1987-2015) y después como fundador y presidente de la Fundación Lucha contra el Sida (1992). ), que ahora se llama Fundación Lucha contra las Infecciones.

El doctor Clotet pronto vio la necesidad de ir un paso más allá de la atención al paciente para llevar a cabo investigaciones destinadas a erradicar el sida. En 1995, con el apoyo de “la Caixa” y del Departamento de Salud de la Generalidad de Cataluña, fundó el Instituto de Investigación del Sida IrsiCaixa, que todavía dirige. Además, el dr. Clotet es también director clínico de Enfermedades Infecciosas del área Metropolitana Norte del Instituto Catalán de la Salud, asesor científico de dos spin-off de IrsiCaixa: Aelix Therapeutics SL y AlbaJuna Therapeutics SL y director de la Cátedra de Sida y Enfermedades relacionadas en la Universidad de Vic (UVic).

Ha publicado más de 1000 artículos en revistas internacionales de alto impacto y sus contribuciones a la investigación han sido reconocidas con la medalla Josep Trueta al Mérito Sanitario y el Premio Nacional de Investigación, entre otros galardones.

Consultant of Gastroenterology, Teknon Medical Centre Barcelona. Miembro del Comité Directivo del consorcio internacional del Microbioma Humano. Presidente del patronato de la Sociedad Española de probióticos y Prebióticos. Organización Mundial de Gastroenterología.

Jefe de Servicio del Hospital Universitario Germans Trias i Pujol. Jefe del Grupo de Genómica Microbiana en el Instituto de Investigación del SIDA IrsiCaixa, Badalona, ​​Cataluña, España.

Médico especialista. Doctor en Medicina. Con formación predoctoral en el Brigham and Women ‘s Hospital Harvard Medical School. Lleva a cabo actividad asistencial ambulatoria con consulta propia. En el ámbito del paciente ingresado es interconsultor de los pacientes con infección por VIH. Comparte su actividad asistencial con la investigación básica en el laboratorio del Instituto de Investigación del Sida IrsiCaixa. Su línea de investigación incluye la genómica microbiana en diferentes perfiles de pacientes. Es profesor asociado de Medicina de la UAB vinculado al Máster en Tratamiento y Patogénesis del Sida y corresponsable del módulo clínico

Joël Doré ha estado trabajando en microbiota durante 38 años. Es un líder internacionalmente reconocido en microbiota humana.

Joël Doré, graduado de Agro Rennes, con una Maestría en Estudios Avanzados en Fisiología Animal Aplicada. Se unió al INRA en Clermont-Ferrand en 1983. Luego obtuvo su doctorado de la Universidad de Illinois en Urbana-Champaign, EE.UU., en 1988, con una tesis sobre la microbiota del rumen, completada mientras era asociado científico contractual en el INRA. Su investigación sobre la microbiota humana comenzó cuando se unió al Centro Inrae en Jouy-en-Josas, en 1990. Desde 2010 hasta 2014, fue subdirector de MICALIS, una de las mayores unidades del INRA (ahora INRAE: Instituto Nacional de Investigación en Agricultura, Alimentación y Medio Ambiente de Francia).

Actualmente es Director Científico de MetaGenoPolis, una unidad del INRAE creada en 2012 y financiada por el programa francés “Investissements d’Avenir”. Su experiencia en el análisis del microbioma intestinal y sus implicaciones en la salud y la nutrición ha sido ampliamente reconocida en la comunidad científica internacional. Joël Doré tiene como objetivo contribuir a una mejor comprensión de la simbiosis humano-microbios para apoyar las decisiones terapéuticas en el ámbito médico, así como recomendaciones basadas en la ciencia en nutrición y salud.

Isabel Gordo es investigadora principal del Instituto Gulbenkian de Ciência en Oeiras, Portugal.
Se licenció en Física por la Universidad Técnica de Lisboa (IST) en 1997 y se doctoró en Genética Evolutiva por la Universidad de Edimburgo en 2002.
Su investigación posdoctoral se llevó a cabo en el Instituto Gulbenkian de Ciência, donde se convirtió en líder del grupo de Biología Evolutiva en 2004.
Su investigación tiene como objetivo comprender mejor lo que determina la diversidad y la evolución de los microbios. De particular interés es el estudio de las mutaciones de resistencia a los antibióticos y la genética de la adaptación microbiana en los microbiomas de los mamíferos.
Ha ganado algunas subvenciones competitivas internacionales: por ejemplo, la Beca ERC en 2010, la Subvención Global para la Salud Intestinal en 2019 y recientemente la Beca Avanzada ERC en 2023.
Fundó la Sociedad Portuguesa de Biología Evolutiva en 2014 y fue elegida miembro de la Organización Europea de Biología Molecular (EMBO) en 2017, y de la Academia Europea de Microbiología (EAM) en 2020.

Gianluca Ianiro obtuvo su título de médico en 2009 summa cum laude en la Universidad Católica de Roma. Se especializó en gastroenterología en la misma universidad. Actualmente es gastroenterólogo en el Centro de Enfermedades Digestivas de la Fondazione A. Gemelli IRCCS y profesor adjunto de gastroenterología en la Università Cattolica del Sacro Cuore en Roma, Italia.

Desde entonces, se ha establecido como un investigador clínico y traslacional clave, centrándose principalmente en el campo de la microbiota intestinal, y ha recibido varias subvenciones de investigación en apoyo a sus investigaciones innovadoras. Su investigación actual se centra principalmente en el diagnóstico del microbioma, en desentrañar las reglas de la implantación del microbioma del donante y en investigar terapias basadas en el microbioma.

Desde 2002, la Dra. Chaysavanh Manichanh utiliza enfoques metaómicos para el estudio del microbioma humano asociado a los trastornos. En 2006, Chaysavanh se incorporó al instituto de VIHR de Barcelona como investigadora principal para continuar su línea de investigación sobre el Microbioma Humano. Ha colaborado con los consorcios MetaHIT y IHMS para construir un catálogo integral de genes a partir del microbioma intestinal humano y desarrollar procedimientos operativos estándar (SOPs) y protocolos para optimizar la comparación de datos en el campo del microbioma humano. Con esta experiencia y su doble experiencia en microbiología molecular (Universidad de París VI, 2001) y en bioinformática (Licenciatura en el Instituto Pasteur, París, 2000), lidera en el VHIR un grupo de investigación multidisciplinario para el desarrollo de herramientas moleculares, celulares y bioinformáticas para entender el papel del microbioma en la salud humana y la enfermedad.

La profesora Siew Ng es profesora en el Departamento de Medicina y Terapéutica, Decana Adjunta (Desarrollo) y Directora Asociada del Center for Gut Microbiota Research en la Universidad China de Hong Kong. Es la Directora del Microbiota I-Center (MagIC). Obtuvo su Licenciatura en Medicina y Cirugía de la Universidad de Londres y el grado de Doctor en Filosofía (PhD) en el Imperial College London.

Se encuentra a la vanguardia de la epidemiología, genética, patogénesis y tratamiento de las enfermedades inflamatorias del intestino en la región de Asia-Pacífico y a nivel mundial. Fue pionera en la investigación sobre el papel de la microbiota intestinal en la salud y la enfermedad, así como en la trasplantación fecal de microbiota y terapias microbianas. También ha realizado varios descubrimientos novedosos y significativos en la investigación sobre la COVID-19.

Ha publicado más de 300 artículos en revistas internacionales, incluyendo Nature Genetics, Cell Host Microbes, Nature Communications y The Lancet. Su trabajo de investigación ha recibido más de 30 premios prestigiosos, incluyendo las Medallas de Oro y Plata en la Exposición Internacional de Inventos de Ginebra 2022, los Premios de Producción Científica Destacada en Educación Superior del Ministerio de Educación, el Sachar Visiting Professorship, el Premio y Profesorado Sir Francis Avery Jones, la Beca de Investigación Médica Sénior Croucher, y el reconocimiento como Investigadora Altamente Citada por Clarivate en 2020 y 2021.

Natalie Silver MD, MS, FACS, es miembro del personal del Cleveland Clinic Head & Neck Institute in Cleveland, Ohio, y trabaja como Directora de Investigación en Cáncer de Cabeza y Cuello. La Dra. Silver es una cirujana-científica con un laboratorio de investigación traslacional que estudia el microambiente inmunológico tumoral en el cáncer oral. Su laboratorio se encuentra en el Centro de Inmunoterapia y Oncología de Precisión del Instituto de Investigación Lerner de la Cleveland Clinic. La Dra. Silver también es oncóloga quirúrgica en cabeza y cuello, especializada en cirugía ablativa y endocrina. La Dra. Silver obtuvo su título de Medicina y su Maestría en Biología Tumoral en la Universidad de Georgetown, seguido de una residencia en otorrinolaringología-cirugía de cabeza y cuello. Asistió al UT MD Anderson Cancer Center para su formación de beca en cirugía oncológica de cabeza y cuello e investigación traslacional. La Dra. Silver ha recibido varias subvenciones de investigación, incluyendo un premio K08 de los Institutos Nacionales de Salud (NIH). Su laboratorio se centra en el desarrollo de vacunas terapéuticas de ARNm para el cáncer de cabeza y cuello, y en explorar el papel de las bacterias intratumorales en los cánceres de cabeza y cuello.

Arnau Vich Vila (PhD) es biólogo computacional e investigador postdoctoral en la Katholieke Universiteit Leuven (Bélgica). Obtuvo un máster en bioinformática por la Universitat Autònoma de Barcelona y realizó su doctorado en Groningen (Países Bajos), donde investigó el microbioma intestinal y su importancia en la salud y la enfermedad, con especial interés en enfermedades gastrointestinales como la enfermedad inflamatoria intestinal (EII). Arnau también ha realizado importantes contribuciones a la comprensión de los factores que dan forma a la composición de la microbiota intestinal, investigando las influencias de la dieta y la medicación a través de extensas cohortes poblacionales como la cohorte LifeLines en los Países Bajos y, actualmente, el Proyecto Flamenco de Flora Intestinal en Bélgica. Además, sus intereses científicos actuales incluyen explorar el papel de la microbiota intestinal en las intolerancias alimentarias y profundizar en las implicaciones metabólicas de la microbiota del intestino delgado.

Sara Vieira-Silva es profesora asociada en el Centro Médico Universitario, JGU Mainz, Directora Adjunta en el Instituto de Biología Molecular (IMB), y miembro de la junta del Instituto de Biociencias Cuantitativas y Computacionales (IQCB). Formada inicialmente en biología y biología computacional (Lisboa, Portugal), realizó un doctorado en genómica evolutiva microbiana, supervisada por Eduardo Rocha en el Institut Pasteur, París, Francia. Como científica postdoctoral (VIB-KULeuven, Bélgica), se especializó en estudiar el metabolismo microbiano específico del entorno intestinal humano y su impacto clínico en el huésped humano.

Sus principales intereses de investigación son definir los límites de la variación del microbiota intestinal humano saludable y el papel de la disbiosis en la enfermedad, especialmente a través de la promoción de la inflamación y el metabolismo microbiano de compuestos bioactivos. Combina su formación en genómica comparativa microbiana y ecología evolutiva, con un diseño experimental basado en hipótesis en estrecha colaboración con expertos clínicos. Adopta y desarrolla enfoques computacionales de vanguardia para estudiar cuantitativamente la contribución de las comunidades microbianas asociadas al huésped a la fisiopatología y la respuesta a la terapia, especialmente en el contexto clínico de trastornos inflamatorios y metabólicos.

El Prof. R.K. Weersma es gastroenterólogo y presidente del Departamento de Gastroenterología y Hepatología en el Centro Médico Universitario de Groningen en los Países Bajos. Su investigación y trabajo clínico se centran en las enfermedades crónicas mediadas por el sistema inmunitario del tracto gastrointestinal. Ha estado trabajando en el papel de la genética del huésped en la susceptibilidad a enfermedades y cómo las variantes genómicas identificadas conducen a enfermedades y su influencia en el comportamiento de la enfermedad. El énfasis recae en integrar datos de “multi-ómica” con datos clínicos de alta resolución mediante el uso de biobancos tanto basados en la población como específicos de enfermedades. En los últimos años, ha estado trabajando en el papel del microbioma intestinal tanto en la salud como en la enfermedad. Es uno de los líderes del Proyecto del Microbioma Holandés y cofundó el Centro del Microbioma de Groningen.